README.md

@@ -1,5 +1,7 @@
 # SCJ_Projekt
 
+# SCJ Projekt
+
 ## Installation
 
 1. **Aktiviere das Projekt**:
@@ -19,8 +21,4 @@ es steht erstmal nur so ein möglicher Projekt Dateiaufbau
 
 ## Nutzung
 
-```bash
+Wenn ihr `scripts/run_simulation.jl` ausführt, sollte sich mit **Makie** eine GUI öffnen, die einen **Slider** hat, mit dem man ein paar generierte Frames angucken kann.
-include("scripts/main.jl")
-```
-
-Wenn der obige Befehl in der REPL ausgeführt wird, öffnet sich mit **Makie** eine GUI, wo unser Produkt zu finden ist!

scripts/main.jl

@@ -6,7 +6,7 @@ using GLMakie
 
 using .Visualization
 
-# CombinedPDEParams
+# GSParams AND FHNParams
 N = 128
 dx = 1.0
 params = (
@@ -23,7 +23,7 @@ params = (
 
 params_obs = Observable{CombinedPDEParams}(CombinedPDEParams(N, dx, params.Du[], params.Dv[], params.F[], params.k[], params.ϵ[], params.a[], params.b[]))
 
-# needed so params in param_boxes are updated
+# need so params in param_boxes are updated
 lift(params.N, params.dx, params.Du, params.Dv, params.F, params.k, params.ϵ, params.a, params.b) do N, dx, Du, Dv, F, k, ϵ, a, b
     params_obs[] = CombinedPDEParams(N, dx, Du, Dv, F, k, ϵ, a, b)
 end

src/utils/constants.jl

@@ -1,5 +1,9 @@
-# This struct includes all parameters needed for FHN and GrayScott
+
-struct CombinedPDEParams
+
+abstract type PDEParams end
+
+
+struct CombinedPDEParams <: PDEParams
     N::Int
     dx::Float64
     Du::Float64

src/visualization.jl

@@ -79,8 +79,7 @@ end
 """
     multi_step!(state, n_steps, heat_obs::Observable, params_obs::Observable; step_method=step_gray_scott!, dx=1)
 
-    returns a new matrix for the heatmap for n steps of computing with the corresponding step_method.
+    returns a new matrix for the heatmap for n steps of computing with the corresponding step_method
-    The step_methods have different names because switching models via multi-dispatching is too complex.
 
     # Arguments:
     - `state`: activator and inhibitor matrices
@@ -112,18 +111,14 @@ end
 function build_ui(U, V, param_obs_map::NamedTuple, params_obs, heat_obs)
 
     reset!(U, V, heat_obs)
-    fig = Figure(size=(1500, 950))
+    fig = Figure(size=(1300, 950))
 
     gh = GridLayout(fig[1, 1])
     dropdown = Menu(fig, options=collect(zip(["Gray-Scott", "FHN"], [:gray_scott, :fhn])))
     gh[1, 1] = dropdown
-    plotgrid = GridLayout()
+    ax = Axis(gh[2, 1])
-    gh[2, 1] = plotgrid
-
-    ax = Axis(plotgrid[1, 1])
-    hm = heatmap!(ax, heat_obs, colormap=:viridis)
-    plotgrid[1, 2] = Colorbar(fig, hm, label="Inhibitor ⇒ Activator")
 
+    hm = Makie.heatmap!(ax, heat_obs, colormap=:viridis)
     deactivate_interaction!(ax, :rectanglezoom)
     ax.aspect = DataAspect()