From bc897e4854cad57a374d3a7810d98043fdc55409 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: 2wenty1ne Date: Sun, 3 Nov 2024 21:42:22 +0100 Subject: [PATCH] small changes --- main.py | 16 ++++++++-------- 1 file changed, 8 insertions(+), 8 deletions(-) diff --git a/main.py b/main.py index a25a535..becd529 100644 --- a/main.py +++ b/main.py @@ -4,22 +4,19 @@ import matplotlib.pyplot as plt img = sitk.ReadImage("Thorax1.0B40f_Downsampled_by_2.nrrd") +# Abstand zwischen Voxelmittelpunkten xSp, ySp, zSp = img.GetSpacing() volumePerVoxel = xSp * ySp * zSp -#print(f"Spacing: \n{xSp = }\n{ySp = }\n{zSp = }\n") print(f"1) Die Voxel sind Quader mit den verschiedenen Seitenlängen: X: {xSp}, Y: {ySp}, Z: {zSp} \n") +# Menge an Voxeln in eine Richtung sizeVector = img.GetSize() xSi, ySi, zSi = sizeVector -print(f"Size: \n{xSi = }\n{ySi = }\n{zSi = }\n") - print(f"2) Das Bild hat in den drei Raumrichtungen {xSi * ySi * zSi} Voxel. \n") print(f"3) Die Methode GetSize() gibt den Typ tuple zurück. \n") - -#Sollte man kontrollieren -print(f"4) Der Bildausschnitt in die drei Raumrichtungen ist X: {xSp*xSi} mm, Y: {ySp*xSi} mm, Z: {zSp*xSi} mm\n") +print(f"4) Der Bildausschnitt in die drei Raumrichtungen ist X: {xSp*xSi} mm, Y: {ySp*ySi} mm, Z: {zSp*zSi} mm\n") # CT-Bild der Lunge erstellen seedList = [(120,140,100)] @@ -30,7 +27,7 @@ sitk.WriteImage(lungs, "lungs.nrrd") lungsArray = np.array(sitk.GetArrayFromImage(lungs)) voxelInLungs = lungsArray[lungsArray > 0].size * volumePerVoxel lungsInLitre = voxelInLungs / 1000000 -#print(lungsInLitre) +#print(f"{lungsInLitre} L \n") # Histogramm des CT-Bilds thoraxArray = np.array(sitk.GetArrayFromImage(img)) @@ -42,7 +39,7 @@ plt.ylabel("Häufigkeit in Millionen (mio)") plt.show() plt.clf() -# Alle Helligkeitswerte der Lunge seperieren +# Alle Helligkeitswerte der Lunge separieren lungsArray1D = lungsArray.flatten() lungBrightness = thoraxArray1D[lungsArray1D > 0] @@ -53,3 +50,6 @@ plt.xlabel("Helligkeitswert in Hounsfield-Einheiten (HU)") plt.ylabel("Häufigkeit") plt.show() plt.clf() + +print("5) In der Lunge treten die Helligkeitswerte ~ -1024 bis -200 auf.") +print(" Bei ~ -900 ist ein peak an Helligkeit zu sehen. \n")